Три месяца назад, когда Норман Озборн расформировал ЗАЩИТу, тысяча двести её агентов отказались переходить на службу в МОЛОТ. Им не хотелось оказаться во власти событий, на ход которых они не могут повлиять. Теперь Дум Дум Дуган мобилизовывает армию бывших оперативников ЗАЩИТы с Ником Фьюри во главе и под знаменем Воющих Коммандос.

В результате разведмиссии с киборгом-агентом Джоном Гарреттом Фьюри выяснил, что федеральный служащий Сет Уотерс вовсе не такой патриот, каким хочет казаться. Он представляет угрозу как МОЛОТу, так и Воющим Коммандос. Фьюри не осталось иного выхода, кроме как вынудить Уотерса отстать от Коммандос и выяснить, кто его хозяева. А значит, придётся сделать немыслимое: поработать сообща с Озборном. Война требует пожертвовать многим: кровью, жизнью, принципами. С кровью и жизнью проблем нет, а вот поступиться принципами дьявольски сложно.